映画は、サクハール国の王子タージ王子が父である国王を失ったところから始まります。どうやら大臣のジョードゥールが王座を狙っているらしい。魔法を操るジョードゥールの陰謀でバグダッドへ行くタージ王子。その道中、ジョードゥールが放った盗賊に襲われます。
奇術師のハッサンに助けられ、バグダッドに到着したタージ王子は、バグダッドの国王とその娘ヤズミン姫に気に入られ、ヤズミン姫の婿として迎えられることになります。そこにジョードゥールが空飛ぶ絨毯に乗って現れ、自分こそがサクハール国の王子だと言います。タージ王子はジョードゥールと決闘しますが、ジョードゥールは不死身の体をもっていました。ジョードゥールは、秘密の場所にある魂の卵を割らないと死なないことが分かります。結局、国王はこの世界で最も価値のある物を持ってきた者に姫と結婚させることにします。
ここから宝探しが始まります。バグダッドから遠く離れた正邪殿に世界中のあらゆることを見ることができる水晶でできた透視眼があることが分かり、タージ王子とハッサンは盗んだ魔法の絨毯で旅立ちます。なんとか透視眼を手に入れるタージ王子とハッサン。その透視眼でジョードゥールを倒すことができる魂の卵の場所を知ります。
タージ王子とハッサンは、魔法の絨毯でバグダッドへ向かいます。しかし、魔法の馬で現れたジョードゥールと盗賊に襲われ、透視眼を奪われます。砂漠でタージ王子は、変わった壺を見つけます。手に取ると中から巨大な壺の怪人が現れます。壺から出してくれたお礼に3つの願い事を叶えてくれるという壺の怪人。そのおかげでハッサンと再会し、魂の卵を手に入れたタージ王子はバグダッドへ帰ります。
バグダッドでは今まさにヤズミン姫とジョードゥールの結婚式が行われるところでした。ジョードゥールが国王とヤズミン姫に魔法をかけたのです。いよいよタージ王子とジョードゥールの戦いが始まります。